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L’Unité focalise ses recherches sur l’étude des interrelations entre micro-organismes commensaux du tube digestif, bactéries pathogènes, alimentation et/ou facteurs environnementaux pouvant conduire des pathologies infectieuses associées aux E. coli diarrhéiques (DEC) et des pathologies digestives ou extra-digestives liées à des dysbioses du microbiote intestinal. Le microbiote, qu'il soit alimentaire ou digestif chez l'Homme ou l'animal, est au cœur de toutes nos thématiques et les recherches sont orientées vers l’étude des fonctions du microbiote en relation avec différents intrants, que ce soient des pathogènes, aliments ou xénobiotiques.

Dans ce contexte, différentes fonctions métaboliques des micro-organismes composant ces communautés de commensaux ou de pathogènes sont étudiées au niveau de leur physiologie, que ce soit à l’échelle du catabolisme ou de l'anabolisme, écophysiologie et/ou physiopathologie. Ces connaissances permettent alors d’envisager le développement de stratégies préventives et/ou curatives.

Le programme de recherche de l'UMR MEDiS est structuré autour de quatre axes thématiques de recherche :

Cette organisation thématique s’appuie sur la mise en commun de compétences complémentaires au sein de l’Unité en physiologie digestive, microbiologie moléculaire, microbiologie anaérobie, physiologie microbienne, et écologie microbienne via des approches omiques (protéogénomique, génomique, métagénomique, transcriptomique, métatranscriptomique et protéomique), de bioinformatique, de biochimie et de biologie moléculaire. Ces recherches bénéficient d’outils présents sur les plateaux technologiques hébergés par l’UMR, i.e. IEM, DIGESTIV, GALBIOPHARM et CAPTURE, ainsi que les plateformes AuBi, PFEM et IRICE-PRIMUM implantées localement et dans lesquelles des scientifiques de MEDiS ont des responsabilités.

Date de modification : 24 mai 2023 | Date de création : 16 mai 2017 | Rédaction : SD