Ob-M-ARCOL : un nouveau modèle in vitro pour comprendre le rôle du microbiote dans l’obésité

Contexte et enjeux

L’obésité, qui constitue un enjeu majeur de santé publique, est associée à des altérations du microbiote intestinal. De nombreuses études ont mis en évidence des différences de composition et de fonctions du microbiote entre personnes saines et obèses, mais les mécanismes à l’origine de ces perturbations restent encore mal compris. Pour répondre à ce questionnement, l’UMR MEDIS (Université Clermont Auvergne et INRAe), en collaboration avec le CHU de Clermont-Ferrand, a développé le modèle in vitro Ob-M-ARCOL (Obese Mucosal Artificial Colon), qui reproduit les principales caractéristiques nutritionnelles, physicochimiques et microbiennes du côlon de patients obèses.

Résultats

Développé à partir de données obtenues in vivo chez l’Homme, le modèle reproduit les conditions de pH, de temps de transit et de disponibilités en nutriments (notamment augmentation des lipides et diminution des fibres) spécifiquement rencontrées dans le côlon des patients obèses, tout en prenant en compte les micro-environnements luminaux et mucosaux. Les résultats montrent qu’un microbiote provenant de donneurs sains, exposé aux conditions reproduisant l’environnement colique des personnes obèses, développe spontanément les principales caractéristiques de la dysbiose microbienne observée chez ces patients. À l’inverse, l’exposition de microbiotes issus de personnes obèses à un environnement colique sain favorise la restauration partielle de certaines populations bactériennes considérées comme bénéfiques. Ces résultats mettent en évidence le rôle déterminant de l’environnement nutritionnel et physicochimique des patients obèses dans la structuration de leur microbiote.

Perspectives

Ob-M-ARCOL constitue une nouvelle plateforme préclinique permettant d’étudier les interactions entre alimentation, environnement colique et microbiote dans le contexte de l’obésité. Il pourra notamment être utilisé pour mieux comprendre les mécanismes impliqués dans la dysbiose associée à l’obésité et pour évaluer des stratégies nutritionnelles, pharmaceutiques ou microbiologiques visant à moduler le microbiote intestinal et à favoriser la restauration d’un écosystème microbien plus favorable à la santé. L’utilisation de microbiotes provenant de différents donneurs pour ensemencer ce modèle permettra également d’étudier la variabilité des réponses à ces interventions et d’aller vers une approche nutritionnelle ou pharmaceutique personnalisée.

Valorisation

Ces travaux ont été publiés en 2026 dans la revue internationale Gut Microbes. Ils ont également fait l’objet d’une douzaine de communications orales ou affichées en congrès nationaux et internationaux. Ce projet a été financé dans le cadre du Programme d’Investissements d’Avenir (projet RESTORBIOME) et de France 2030 (projet NUTRITIOUS).

Référence bibliographique

Uriot O. et al. Colonic nutritional and physicochemical parameters drive gut microbiota dysbiosis in obesity: what we learned from the Ob-M-ARCOL model development. Gut Microbes, 2026. DOI: 10.1080/19490976.2026.2685908.