Contexte et enjeux

De nombreuses publications soulignent le rôle crucial du tractus gastro-intestinal dans la santé humaine, les effets des nutriments, des principes actifs et des xénobiotiques ingérés oralement étant fortement influencés par leurs interactions avec le microbiote intestinal. Les essais cliniques restent limités et coûteux, et l’extrapolation des données obtenues chez l’animal à l’Homme difficile en raison de différences en termes d’alimentation, de physiologie digestive et de microbiote. Dans un contexte de réduction de l’usage des animaux à des fins de recherche (3R), l’objectif du réseau COST INFOGUT est de rassembler des experts académiques, industriels et des instances règlementaires avant d’harmoniser et d’optimiser les modèles in vitro reproduisant le microbiote humain ou animal.

Résultats

L'action COST INFOGUT est divisée en 5 groupes de travail (GT), GT1 : Revue des modèles in vitro du colon humain et établissement de lignes directrices harmonisées pour permettre une meilleure comparaison des données provenant de différents modèles. GT2 : Extension à d'autres compartiments que le côlon (cavité orale et intestin grêle) et prise en compte des interactions avec les cellules de hôte. GT3 : Extension aux situations pathologiques, notamment aux maladies métaboliques. GT4 : Sciences et gestion des données omiques issues de l’analyse du microbiote intestinal. GT5 : Réglementation, éducation, transfert de technologie, formations et diffusion. Il réunit actuellement plus de 400 participants de 37 pays européens.

Perspectives

La nouvelle action COST INFOGUT permettra de combler le manque de connaissances techniques, scientifiques et règlementaires sur les modèles in vitro simulant le microbiote intestinal chez l’Homme et l’animal, en proposant des protocoles expérimentaux harmonisés et robustes. Ils permettront de mieux comprendre le devenir de composés d’intérêt ingérés oralement dans l’environnement digestif humain et animal, en prenant en compte les interactions complexes avec le microbiote intestinal et les cellules de l’hôte. De plus, des outils éducatifs innovants seront proposés pour former les jeunes chercheurs et sensibiliser la société et les instances règlementaires à ces méthodes alternatives à l’expérimentation animale.

Valorisation

Les actions menées dans le COST seront valorisées par des publications et actions de communication envers la communauté scientifique, les industriels, les instances règlementaires et aussi le grand public, par l’intermédiaire notamment de « training schools», de mobilités entre partenaires du COST, de formations des jeunes chercheurs, de revues de la littérature (modèles in vitro avec du microbiote en situation physiologique et pathologique) et de directives pour l’harmonization des protocoles expérimentaux de fermentation in vitro chez l’Homme et l’animal.

Références bibliographiques : Proceeding du 1^er meeting général du COST INFOGUT à Bologne (Italie, Mai 2025)