Conservation microbiote oral et intestinal

CONTEXTE ET OBJECTIFS

La congélation immédiate des échantillons est une solution efficace afin de préserver l’intégrité de toutes les communautés microbiennes. Néanmoins, cette technique ne peut pas être applicable dans certains contextes, tels que les essais cliniques ou encore les études de cohorte. Afin de pallier ce problème, il est envisagé d’utiliser des solutions de conservation pour assurer le maintien des populations présentes dans les échantillons jusqu'à leurs analyses.

Les travaux visent à déterminer l’impact de différentes techniques de conservation sur les populations microbiennes de la salive et des selles. Ces travaux permettront d’assurer que les cryoprotectants utilisés n’impactent pas la composition et les activités métaboliques microbiennes, ainsi que les interactions entre espèces microbiennes. Cela permettra de garantir que les analyses réalisées à partir de ces échantillons dans les études sur la santé et les maladies humaines sont représentatives et fiables. 

COLLABORATION

Dr. Mathieu ALMEIDA (INRAE)

FINANCEMENT

ANR - PEPR SAMS - Preanalytics

 

CONTACTS

Ingrid COUTURIER : Ingrid.couturier [at] uca.fr
Stéphanie BLANQUET-DIOT : stephanie.blanquet [at] uca.fr