VIROME ET WESTERN DIET

CONTEXTE ET OBJECTIFS

Les études sur le microbiote se sont longtemps limitées à l’étude des bactéries intestinales. En particulier, l’étude des populations virales peut présenter des difficultés techniques liées à leur détection, leur identification et leur isolement. Tout comme les bactéries intestinales, la composition de ce virome peut être influencée par différents facteurs environnementaux, notamment le régime alimentaire.

L’objectif de ces travaux consiste à étudier l’impact d’un régime pauvre en fibres sur le virome intestinal en modèle in vitro M-ARCOL. Les échantillons collectés au cours de la fermentation colique in vitro permettront l’analyse de la composition du microbiote intestinal, et notamment des populations virales par des approches de séquençage du virome, complétée par une approche de métabolomique.

COLLABORATION ET FINANCEMENT

Dr. Mathieu ALMEIDA

 

Dr. Eugen PFEIFER

 

CONTACTS

Ingrid COUTURIER : ingrid.couturier [at] uca.fr
Stéphanie BLANQUET-DIOT : stephanie.blanquet [at] uca.fr